cPanel。世界有数の商用サーバ管理ソフト。
信頼性は高いが、とはいえどもサーバ管理は一筋縄ではいかないもの。

■基本は、cPanelの最新版を維持して、アナウンスに従って管理する

これが大切。
でも、日本人にはあまりよろしくない仕様や、cPanel自体にバグややはり、融通の利かない点もたまにあるので、どうしてもおんぶにだっことは言えない。

そうすると、「ここは最新でここは古い」などということになり、問題が起こることも。
どうしても困った場合は、最終手段。

/scripts/upcp --force

アップデート後、なぜかpure-ftpの認証が全てはじかれる事態が起こったが、これのおかげでcPanelがよきにはからってくれた。
※正確なソースではないが、ukでhostingをされているchirisさんという方も同様の問題に陥った際に、cPanelサポートスタッフにperlモジュールを入れてもらって助けてもらったという話がが。

対応もマシンによっては10分前後で終わることもあり、サービスのダウンを最低限に復旧ができます。

ただ、注意点。
特にmysqlは鬼門。３年ほど前には、いっきにmysql4.1系（知る人ぞ知る、日本人殺しのバージョンアップ）をされてしまったり、最近もなぜかパスワード認証方式を勝手に変えて、アップデートをしたり。

念には念を押して、バックアップを取ったり、設定ファイルをクローンしたり。
慎重にアップデートを。
特に、サンドボックスで最新版を常に維持するようにすると、安心かもしれません。

今日は他には、easyapacheの問題も。
単純に、最新版はかなり安定しているが、旧版はもう動作自体もかなり厳しい。そのため、upcpをして最新版を利用して、Apacheビルドを行うのが推奨されます。
最新版はかなり凄い！PHPもデュアル環境（4と5）もできれば、オプションの個別設定も可能。（./configure）
他にApacheモジュールもかなり豊富に設定できます。